中国科学院学部第九届学术年会

The 9th Academic Conference of the Academic Divisions, CAS

2024年学术年会

学术报告

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合成科学发展的新路径
报告题目:

合成科学发展的新路径 New Pathways for the Development of Synthetic Science

樊春海 FAN Chunhai 化学部
报告人简介  

樊春海,中国科学院院士,上海交通大学王宽诚讲席教授,化学化工学院院长、转化医学研究院执行院长、国家转化医学科学中心唐仲英首席科学家。十余份国际知名杂志副主编、编委。入选中国医学科学院学部委员,美国科学促进会(AAAS)、国际电化学学会(ISE)、美国医学和生物工程院(AIMBE)、中国化学会(CCS)和英国皇家化学会(RSC)会士,自2014年起连续入选“全球高被引科学家”。

报告摘要

合成科学是目标导向的创造物质的科学,其最显著特点就在于其强大的创造力,不仅可以制造出自然界业已存在的物质,还可以创造出自然界中不存在的、具有理想性质和功能的新物质。合成科学包含了合成化学和合成生物学两个既相互独立、又密切关联的领域。本报告从“合成化学促进的合成生物学”、“合成生物学促进的合成化学”以及“三大生命物质的合成及其他”三个版块,重点关注合成化学与合成生物学的交叉特色和相互融合的特点,从两大学科互相促进的角度展示了合成科学发展的历史、现状、趋势和挑战,强调了基于化学和生物学以及其它相关学科在分子层次上的高度融合。

报告全文

(本文由科学大院根据樊春海院士在中国科学院学部第届学术年会上的报告《合成科学发展的新路径》整理而成,首发于科学大院)

今天跟大家分享的报告是跟奎岭院士一起准备的我们对于合成化学和合成生物学交融发展,也就是合成科学发展新路径的思考。这是我汇报的提纲。

如何理解合成科学

我想可以这样来理解合成科学合成科学是分子创制的核心和基础,研究化学活化断裂和重组的规律,诠释分子转化的本质,聚焦合成过的精准性、变革性和分子功能的导向性。现在分子合成跟生命健康、农业、材料、能源等等各种领域密切相关,可以说是彻底改变了人类社会生产和生活的方式

CA(美国《化学文摘》,Chemical Abstracts,简称 CA数据库登记的化合物现在已经超过了1.5亿个。1.5亿个化学物质正好是一种抗癌的药物,是202158日合成出来的这个数据库里的化合物大部分是人工化学合成的,而根据化学空间理论的预测,人类可以合成的化合物的数量可以达到1063,所以这是一个巨大的空间。

合成创造价值分子影响世界人类合成的众多药物创造巨大的价值其中包括中国的人工合成牛胰岛素人工合成青蒿素。而合成氨催化剂液晶等分子已经彻底改变了世界,改变了我们的生活。

从分子合成发展的历程来看1828年维勒用人工的方法从无机物合成出尿素,从此有机合成化学就诞生了。1860年代诺贝尔发明了安全的硝化甘油炸药,从而获得了巨额财富,后来创立了大家非常熟悉的诺贝尔奖。之后分子合成经过了从平面到立体从小分子到大分子从简单到复杂的过程现在进入了精准、高效、功能化的时代可以说,诺贝尔化学奖历史也是物质创制和合成的历史已经颁发的100多次的诺贝尔化学奖当中,近半数是和合成相关的。

合成科学核心科学问题

合成科学现在核心的科学问题精准和功能

现在合成化学已经达到了空前成熟的水平。很多合成化学家认为,无论分子多么复杂,经过一段时间总能顺利合成出来,像海葵毒素这样高度复杂的分子都已经被合成出来了。

同时合成化学开始进入简约和功能主义的时代下面2022第二次获得诺贝尔化学奖的巴里·夏普利斯K. Barry Sharpless教授的贡献为例

他在2001年就以在手性合成化学方面的贡献获得了一次诺贝尔奖能够再次获得诺贝尔奖的重要原因是发展了一个与前人理念截然相反的方法,命名为click chemistry即点击化学所谓的click 就像我们坐车的时候咔嚓一下系上了安全带形容这种合成方式非常简单。这种全新的合成化学方法,可以说改变了我们对于化学的理解,甚至推动了生命科学的发展。普里斯教授在上海的转化医学国家重大科学设施建立了“点击实验室”,用这种非常简便的方法可以以全球最快的速度完成药物前体库的创制合成。

就像诺贝尔化学奖获得者野依良治教授所说未来的合成必然是经济的安全的、环境友好以及节省资源和能源的所谓完美的合成化学。他特别强调指出要实现上述目标与其说依赖技术上的进步,不如归结为依赖基本科学问题的解决

我们特别关注生物合成,也就是探究自然的智慧和奥秘,向自然学习的合成化学从基础层面来说,是一种自然进化蛋白质,实际上就是一种高效高专度的催化剂,为合成化学提供了无数智慧和线索。从应用层面来讲,基于生命的“细胞工厂可能提高产量,加速分子的进化演变并拓展用途,这也就是现在特别热门的合成生物学,也是合成科学的新机遇,用生物制造来引领第四次的工业革命

很多数据都表明,用合成生物学的思路,我们有可能实现安全节能、绿色、低碳、可持续的合成。

合成科学的机遇与挑战

正因为这样,合成生物学也得到了世界各国的热捧,多次评为十大颠覆性技术,可以说是新一轮国际生命科学技术发展的前沿焦点和必争之地。

上海交通大学,我们在丁奎岭校长的领导下也承接了合成生物学的多项目,比如说上海的重大科技专项最近依托上海交通大学的新加坡研究生院,我们跟新加坡国立大学合作,获得了新加坡国家基金会全额资助的负碳合成生物学项目。教育部怀进鹏部长和丁奎岭校长都出席了该项目的启动仪式。从一定意义上来讲,这些基础或者说是应用基础研究,也可以对一带一路科学合作起到很好的推动和促进作用。在这样时代背景下,合成科学面临化学合成和生物合成交融发展的全新机遇。

但是这个领域也存在一系列的争论2012年,合成化学领域的著名专家·巴伦Phil S·Baran和合成生物学领域的领头人杰·基斯林Jay D. KeaslingNature杂志进行了“有建设性的争议,分别强调了各自领域的优势和缺点。

在过去十几年里,我们一方面确实可以看到合成生物学的快速发展,应用合成生物学的方法制造了很多跟能源、材料、药物、食品相关的全新分子,可以说“生物制造制造万物”。但是,我们也看到了合成生物学发展瓶颈问题,比如说从2021年之后,全球的投资热度下降,领军企业面临着困难,当然是很多新技术新领域共同面临的趋势——经过高热度发展之后会有一个冰点不过又会再次腾飞。

把合成化学跟合成生物学结合起来协同创新融合发展,形成跨越化学和生物学的合成科学,把握建立合成科学新格局,把握新一轮科技革命和产业革命重大机遇的制高点

融合化学与生物的合成科学

化学合成和生物合成交融发展的合成科学,可以分为三大方向合成生物学促进的合成化学,合成化学促进的合成生物学,以及三大生命物质的合成。

首先是合成生物学促进的合成化学包括以下三个方面:

  1. 仿生催化。来自自然来自生命的酶,始终是催化化学发展的智慧源泉。仿生催化的发展,可以促进更加绿色高效的合成,特别是为实现碳氧绿色循环提供新思路。举个例子,前几年刚刚获得诺贝尔奖仿生有机分子的催化是模仿了非金属酶。值得注意的是,在模仿金属酶的仿生催化当中,我们中国科学家也作出了很多贡献,包括在座的几位院士取得了里程碑式的进展。
  1. 仿生全合成全合成是有机化学的精髓。生源合成途径启发来优化全合成的路线设计,可以为绿色制造提供有效的解决方案。
  1. 非天然反应。生物催化多样性的根本原因说自然进化,现在人工设计基于对定向化科学规律的认识比如说酶的智能设计能够促进生物催化剂在非天然反应方面的应用,有可能极大拓展生物催化的多样性。

第二个方面就是合成化学促进的合成生物学包括以下四个方面:

  1. 生物合成化学。生物合成化学仿生催化和合成生物学发展的智慧源泉。它的发展对合成生物学的理论基础和技术支撑都是非常有益的有可能为仿生催化仿生合成提供全新的思路。比如说2015年获得诺贝尔奖的阿维菌素,里面涉及到一系列的新的酶学机制和新合成途径的发现。
  1. 组合生物的合成组合生物合成是利用生物体系来创造结构多样性的重要方法,可以对结构复杂的天然产物进行高效精准的结构改造和优化,从而为药物筛选提供更多优质化合物资源。简单的讲就是可以扩大天然产物库。
  1. 异源生物合成这有助于缓解大化学品、生物料、生物材料等成本环境和资源协调方面的问题,有效弥补有机化学在复杂天然产物合成当中的不足,从而突破来源稀缺的复杂天然药物的供给瓶颈问题后者是现在非常大的问题,因为很多来源于植物的药物,完全依靠天然的原料那是远远不够的。
  1. 生物合成研究的新策略,新技术和新方法生物合成研究是合成生物学的元件基础。AI for everything”“AI for science的时代,AI赋能的合成生物学,完全有可能来突破当前生物制造的瓶颈,比如Alphafold为蛋白质的全新设计提供了极大的便利。未来物质的变革性合成方面,可以说是颠覆性的创新。

第三个方面是三大生命物质的合成

生物学中最基本的中心法则是从基因转录、翻译变成发挥功能的蛋白质DNARNA统称为核酸,核酸蛋白质是两大生命物质各种各样的药物基因药物、核酸药物、蛋白质药物,包括小分子都是作用在这两大生命物质上第三类生命物质是糖类对生命过程具有很复杂又很精细的调控作用。

  1. 核酸的合成核酸合成是非常典型的化学合成跟生物合成耦合的研究领域,核酸的合成是现代先进生物技术发展的底层支撑。当今核酸合成正在向高通量合成产物功能化合成DNA化的合成这样三个方向在发展。

合成人工的染色体人工生命迈出了重要的一步。成功合成了人造的染色体可以实现对生命活动的调控。在这个方面,我们国家的科学家也作出了非常重要的贡献。

核酸合成的一个新领域就是DNA信息存储。这是BT-IT的交融,也就是生物技术和信息技术的交融,把碳基生命的 DNA核酸分子用来存储信息现在的信息是硅基比如芯片等存储的但是面海量的爆炸式信息增长,数据存储可以说已经成为国家的战略需求。DNA正是一种替代性变革性的存储介质DNA来存储数据,特别是存储不常用的冷数据,可以把存储的容量极限提升7个数量级

国家十四五科技规划Science提出的125个科学问题,我们都可以看出国际上国内对相关领域的重视程度上海交通大学和一些兄弟院校都在积极的努力,通过交叉的方式来推动这方面的发展。

  1. 蛋白质的合成蛋白质化学合成为获取难以生物制造的蛋白质带来全新的可能性。人工合成蛋白质不仅可以让我们获得新的蛋白,还能助力生化功能机制研究、助力蛋白药物与蛋白材料研发、助力合成生物学与生命起源研究我国之前的人工合成胰岛素就是一个非常典型的案例。人工合成的的司美格鲁肽,它是一种降糖药物,当然也是一种减肥药物。通过镜像的生命合成,我们合成完全手性对称的蛋白质,未来也许可以创造完全不同的生命,生命起源的认识带来启发。
  1. 糖的合成相对于核酸和蛋白质,人类对的认识和理解是非常浅的,甚至可以说这里还是处女地”。最重要的问题在于我们现在核酸合成和蛋白质合成的技术都已经相对成熟,而精准合成糖还是比较困难的

促糖苷化是糖化学发展的智慧源泉。仿生糖苷化反应的发展将促进合成更加绿色高效,为基于糖的药物的发展提供强大的动能,同样它也完全有可能极大推动我们对生命的认识和理解。

综上所述,未来合成科学面临着这样一个新的趋势——融合化学和生物学。我们认为以下四个方面是值得重点关注的:

第一是探索生物合成的底层机制,包括了酶结构和催化功能的关系,酶的动态催化机制,生物转化的化学原理和复杂分子的生物合成策略等

第二是模拟生物体系的物质能量转化过程通过构筑高效的仿生催化剂和人工酶,发展高效的仿生反应,实现各种功能分子的高效精准创造

第三是聚焦具有重大战略价值的分子合成,充分发挥化学合成和生物合成各自的优势,对接生命健康能源材料,碳中和人工固氮等重大经济领域和社会的重大问题

第四是拓展对于生命和自然的认识,从新的角度去理解地球演化、环境失衡、生命进化、健康和疾病等基础性的方向,从而提出创造性解决方案。

合成创造未来

最后我想跟大家分享雨果的一句话:“与有待创造的东西相比,已经创造出来的东西是微不足道的

科技创新的前沿是永无止境的我们希望通过交融的合成科学新路径,通过合成来创造价值,用我们创造的分子来影响和改变世界

谢谢大家。