自2000年以来，以“摸清家底，发现问题，找出原因，提出对策”为目标，生态环境部与中国科学院联合组织每五年一次的全国生态调查与评估，至今已开展四次，取得一系列重要成果，为国家生态文明建设、生态保护政策制定、国土生态安全格局构建提供了科学基础。

在全国陆地生态系统调查评估中，建立了以遥感技术为基础的全国陆地生态系统三级分类体系；以生态系统格局—质量—服务—问题为主线，建立了全国/区域陆地生态系统评估指标与模型；综合利用遥感数据、地面调查数据，以及部门资源环境监测数据，生产了全国自2000年以来，每5年一期的全国陆地生态系统分类与生态参数数据集，开展了每5年一次的全国陆地生态系统格局、质量、服务、问题特征及其变化趋势与驱动力，评估报告由生态环境部与中国科学院联合分布。

调查评估发现，自2000年以来，全国森林、湿地面积增加，耕地、草地、荒漠面积不断减少，生态系统格局局部变化剧烈。生态安全问题总体向好，但仍然严峻，生态系统质量低下，但总体持续改善；沙化、水土流失土地面积大，但总面积与程度在降低；生态系统人工化趋势加剧。全国生态问题处于转型期，农业生产导致的生态问题好转，城镇化与工业化导致的生态问题恶化。城镇化、资源开发、农业发展，以及生态保护政策措施是我国生态系统格局与生态环境问题变化的主要原因。生态保护与建设重大工程的实施，对遏制全国生态退化发挥了重要作用。

全国陆地生态系统调查评估的数据与成果直接应用与支撑了全国及省市区生态保护规划与政策的制定，包括全国生态功能区划、全国主体功能规划、生态保护红线规划、国家公园空间布局规划、生态转移支付范围的确定，以及“十二五”“十三五”“十四五”国民经济综合发展规划与各省市区的生态保护规划等，并为中央生态环境保护督察、国家级自然保护区的监测提供了数据与方法支撑。基于项目提出的方法与技术，形成生态系统调查评估相关的8个国家标准、生态环境行业技术规范24个。还在Science, PNAS, Nature Ecology & Evolution, National Science Review等期刊上发表了系列论文。为促进生态系统调查、监测与评估的科技发展、推动生态系统服务与生物多样性保护主流化发挥了积极作用。