⼤⾖是重要的经济粮⻝饲料作物，是⼈类和牲畜优质植物油和蛋⽩的主要来源。近年来，我国⼤⾖消费维持在 1.2 亿吨左右，但80%以上依赖进⼝。我国⼤⾖单产远低于国外，是世界平均单产的60%左右；同时，我国⼈多地少，在现有 18 亿亩耕地难以进⼀步扩增⼤⾖种植⾯积。创新育种理论，培育突破性⾼产优质耐逆新品种，⼤幅度提⾼单产和利⽤边际⼟地扩增种植⾯积是我国⼤⾖的重⼤需求。

针对这⼀国家重⼤需求，团队开展了⼤⾖分⼦设计育种⼯作。构建了世界⾸个⼤⾖图形泛基因组，绘制了全球近 3000 份代表性⼤⾖种质的遗传变异图谱，系统解析了⼤⾖种质资源演化遗传基础，通过对⼤⾖驯化和改良过程中遗传变异的系统研究，⾸次揭示 DNA遗传变异和表观遗传变异是相对独⽴发⽣的，解析了⼤⾖多倍化和驯化中重复基因的演化规律，为种质资源利⽤和分⼦设计育种提供了理论基础；创新多组学联合分析⽅法，挖掘和功能解析了控制⼤⾖产量、品质、耐逆和适应性的相关基因，为⼤⾖设计育种提供了重要基因资源；创新性状分析⽅法，解析了⼤⾖重要农艺性状的多性状遗传调控耦合⽹络，发现了不同性状协同调控的关键调控位点，建⽴了⼤⾖分⼦设计育种体系。成功培育出科⾖ 10、科⾖ 2号、科⾖ 7 号、科⾖ 17、科⾖ 24、科⾖ 103、晋⼤ 88 等⾼产优质⼤⾖新品种。同时，创新性地开展了耐盐⼤⾖种质资源筛选、品种选育等研究⼯作。选育的“科⾖ 35”等系列新品系在东营盐碱地⼤⾯积示范亩产超过 300 公⽄。