人体微生物组与疾病存在广泛关联，有望成为众多疾病诊治防新靶标。其走向临床应用关键有两点：一是运用动物模型阐明因果机制，二是通过多中心临床研究明确菌群标志物的证据级别。我将首先综述国际国内关于人体微生物组临床研究的进展，再介绍本课题组开展的相关基础与临床研究。本课题组基于前期发现的区域间疾病特征菌谱的异同，提出“菌群模型的地域依赖性”假说。我们建立了中国临床微生态研究协作组（CALM）平台，针对课题组前期发现的子痫前期、卒中、炎性肠病等菌群与疾病因果线索，开展母婴、卒中、育龄期女性生殖道、早产儿、肠道疾病、以及多种重疾等多项人体微生物组多中心临床研究，以期阐明我国跨区域多种疾病的关键特征菌，以推动以肠道菌群为代表的人体微生物组新型标志物的临床转化。