由于缺少阳光，洞穴生态系统缺乏直接来自光合作用的有机质，加上地理位置相 对隔离、常年恒温、较高的 CO2 浓度等，洞穴通常被认为是一种寡营养的极端环境， 是研究地下生物圈的天然实验室。洞穴中孕育着大量未知的资源微生物，尤其是放线 菌，它们是抗生素最重要的来源，是人们寻求新药物的重要基地。当然，洞穴微生物 如真菌也能破坏洞穴中宝贵的壁画等文化遗迹，甚至导致洞穴蝙蝠白鼻病的爆发，给 洞穴生态系统带来毁灭性的打击。同时由于碳酸盐洞穴中也发育了大量的石笋，保存 了十分丰富的古气候变化信息，因此也使洞穴成为古气候研究中的热点地区。洞穴石 笋记录的古气候信息不仅能提供季风的变化，还能通过保存在石笋中的微生物化合物 等信息，反映古温度和古降水的变化，为了解人类文化的变迁提供重要线索。因此， 洞穴无论在科学研究、资源开发和生态系统的维持中都具有十分重要的意义。